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经证实，日本政府保存了日本帝国主义侵略时期从韩半岛运走的文化遗产目录，但日方担心韩国要求归还，所以长期隐瞒这一事实。1965年韩日邦交恢复正常的过程中，日本有选择地归还了文化遗产，贵重的文化遗产未被列入归还目录，而且日方还保存了证明其掠夺文化遗产的文件。

日本外务省东北亚科科长小野启一在代替日本政府提交给东京高等法院的陈情书中指出：“市民组织要求公开的文件中包含没有告知韩国政府的文化遗产目录。如果公开，韩方可能会要求归还。”

日本市民组织“要求全面公开韩日会谈文件的集会”提起诉讼要求公开相关文件后，东京地方法院于2012年10月做出判决，要求公开宫内厅书陵部保管的书籍目录、东京国立博物馆保管的韩国文化遗产一览表、寺內文库相关记录等文件。为推进韩日邦交正常化，日本政府对韩半岛文化遗产的外流原委、购买价格等情况进行深入调查后制定了这些文件。但日本政府提起上诉，认为公开这些文件后可能会损害国家利益。而东京高等法院25日接受这一主张并做出不公开的判决。

小野启一在陈情书中表示：“要求公开的文件中还包括（日本）有关人士对归还给韩国的宫内厅书陵部书籍做出的（学术）价值低的评价。”日本1965年根据《韩日协定》返还给韩国的1431件文化遗产中甚至包括草鞋、钱包、普通印章等物品，所以当时就被指故意返还价值低的文化遗产。

小野启一还指出：“（文件中）包含难以让韩国信服的（外流）原委，虽然只是学者的推测，但公开后还是会引起韩国政府和国民对日本的强烈谴责。”也就是说，因为文件中包含日方掠夺韩半岛文化遗产的原委，所以不能公开。